Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NumblO08919 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NumblO08919 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NumblO08919 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NumblO08919 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NumblO08919 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NumblO08919 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NumblO08919 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NumblO08919 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NumblO08919 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NumblO08919 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NumblO08919 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NumblO08919 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NumblO08919 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NumblO08919 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NumblO08919 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NumblO08919 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NumblO08919 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NumblO08919 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NumblO08919 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NumblO08919 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NumblO08919 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NumblO08919 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NumblO08919 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NumblO08919 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NumblO08919 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NumblO08919 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NumblO08919 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NumblO08919 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NumblO08919 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NumblO08919 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms