Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gfra2O08842 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms