Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd3O08739 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd3O08739 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd3O08739 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd3O08739 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms