Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp12O08736 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp12O08736 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp12O08736 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casp12O08736 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp12O08736 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms