Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d1O08532 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d1O08532 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms