Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20939L7N243 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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