Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc191J3QQ27 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc191J3QQ27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms