Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8298J3QPI0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8298J3QPI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms