Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933406M09RikG3XA12 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms