Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r39G3UWE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms