Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5160F8VPN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms