Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl9F7BE40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl9F7BE40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl9F7BE40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl9F7BE40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl9F7BE40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms