Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm2564F6Z9S8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm2564F6Z9S8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2564F6Z9S8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Gm2564F6Z9S8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm2564F6Z9S8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms