Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sptbn5F6UCX4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptbn5F6UCX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptbn5F6UCX4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms