Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa35E9QLQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa35E9QLQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa35E9QLQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa35E9QLQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa35E9QLQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms