Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd7E9Q9W7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms