Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc1E9Q5K9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc1E9Q5K9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ythdc1E9Q5K9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216 ms