Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip11E9Q512 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip11E9Q512 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip11E9Q512 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms