Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde8bE9Q4S1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pde8bE9Q4S1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde8bE9Q4S1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde8bE9Q4S1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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