Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230217C12RikE9Q3Z1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230217C12RikE9Q3Z1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms