Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Susd1E9Q3H4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd1E9Q3H4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms