Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3250E9Q1M3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3250E9Q1M3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms