Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx60E9PZQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx60E9PZQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
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