Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcom1E9PZ54 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcom1E9PZ54 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcom1E9PZ54 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms