Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph10bE9PYQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph10bE9PYQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms