Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp54bE9PXC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp54bE9PXC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp54bE9PXC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms