Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930455H04RikD3Z622 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930455H04RikD3Z622 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930455H04RikD3Z622 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms