Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf217D3YYI7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf217D3YYI7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms