Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm4297D3YWB7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4297D3YWB7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm4297D3YWB7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4297D3YWB7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms