Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rd3lB2RV38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms