Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2B1AVH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tbc1d2B1AVH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tbc1d2B1AVH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2B1AVH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2B1AVH7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2B1AVH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tbc1d2B1AVH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms