Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Grik3B1AS29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik3B1AS29 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms