Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2c2A7L9Z8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2c2A7L9Z8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2c2A7L9Z8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2c2A7L9Z8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2c2A7L9Z8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2c2A7L9Z8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms