Protein–RNA interactions for Protein: A6H8H5

Kcnb2, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb2A6H8H5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnb2A6H8H5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnb2A6H8H5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnb2A6H8H5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms