Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp8b5A3FIN4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms