Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb1A2AQ07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms