Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lcn6A2AJB9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn6A2AJB9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn6A2AJB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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