Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34dA2AGU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34dA2AGU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34dA2AGU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms