Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup62clA2AG10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62clA2AG10 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms