Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trav12-2A0N8N6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav12-2A0N8N6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms