Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms