Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms