Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPC3

Cyp4a29, Cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 29, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4a29A0A087WPC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4a29A0A087WPC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4a29A0A087WPC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp4a29A0A087WPC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4a29A0A087WPC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms