Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer3W4VSP1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer3W4VSP1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer3W4VSP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer3W4VSP1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer3W4VSP1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer3W4VSP1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer3W4VSP1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer3W4VSP1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer3W4VSP1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer3W4VSP1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer3W4VSP1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer3W4VSP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer3W4VSP1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer3W4VSP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer3W4VSP1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer3W4VSP1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer3W4VSP1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer3W4VSP1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer3W4VSP1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer3W4VSP1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer3W4VSP1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer3W4VSP1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer3W4VSP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer3W4VSP1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer3W4VSP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer3W4VSP1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer3W4VSP1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer3W4VSP1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer3W4VSP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer3W4VSP1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer3W4VSP1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer3W4VSP1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer3W4VSP1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Speer3W4VSP1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer3W4VSP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer3W4VSP1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer3W4VSP1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer3W4VSP1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer3W4VSP1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer3W4VSP1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer3W4VSP1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer3W4VSP1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer3W4VSP1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer3W4VSP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer3W4VSP1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Speer3W4VSP1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer3W4VSP1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer3W4VSP1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer3W4VSP1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer3W4VSP1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer3W4VSP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer3W4VSP1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms