Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc166S4R181 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc166S4R181 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc166S4R181 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc166S4R181 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc166S4R181 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc166S4R181 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc166S4R181 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc166S4R181 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc166S4R181 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc166S4R181 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc166S4R181 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc166S4R181 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc166S4R181 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc166S4R181 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc166S4R181 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc166S4R181 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc166S4R181 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc166S4R181 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc166S4R181 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc166S4R181 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc166S4R181 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc166S4R181 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc166S4R181 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc166S4R181 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc166S4R181 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc166S4R181 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc166S4R181 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc166S4R181 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc166S4R181 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc166S4R181 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc166S4R181 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc166S4R181 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc166S4R181 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc166S4R181 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc166S4R181 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc166S4R181 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc166S4R181 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc166S4R181 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc166S4R181 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc166S4R181 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc166S4R181 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc166S4R181 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc166S4R181 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc166S4R181 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc166S4R181 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc166S4R181 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc166S4R181 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc166S4R181 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc166S4R181 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc166S4R181 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc166S4R181 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc166S4R181 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc166S4R181 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc166S4R181 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc166S4R181 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc166S4R181 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc166S4R181 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc166S4R181 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc166S4R181 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc166S4R181 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc166S4R181 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc166S4R181 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms