Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd2Q9Z2E1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd2Q9Z2E1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd2Q9Z2E1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd2Q9Z2E1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd2Q9Z2E1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd2Q9Z2E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd2Q9Z2E1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd2Q9Z2E1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd2Q9Z2E1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd2Q9Z2E1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd2Q9Z2E1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd2Q9Z2E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd2Q9Z2E1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd2Q9Z2E1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd2Q9Z2E1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd2Q9Z2E1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd2Q9Z2E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd2Q9Z2E1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd2Q9Z2E1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd2Q9Z2E1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd2Q9Z2E1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd2Q9Z2E1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd2Q9Z2E1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd2Q9Z2E1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd2Q9Z2E1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd2Q9Z2E1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd2Q9Z2E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd2Q9Z2E1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd2Q9Z2E1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd2Q9Z2E1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mbd2Q9Z2E1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd2Q9Z2E1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd2Q9Z2E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd2Q9Z2E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd2Q9Z2E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd2Q9Z2E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms