Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
RfxankQ9Z205 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
RfxankQ9Z205 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
RfxankQ9Z205 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RfxankQ9Z205 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
RfxankQ9Z205 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
RfxankQ9Z205 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
RfxankQ9Z205 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
RfxankQ9Z205 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
RfxankQ9Z205 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
RfxankQ9Z205 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,7■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
RfxankQ9Z205 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
RfxankQ9Z205 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
RfxankQ9Z205 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RfxankQ9Z205 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
RfxankQ9Z205 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
RfxankQ9Z205 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
RfxankQ9Z205 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
RfxankQ9Z205 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
RfxankQ9Z205 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
RfxankQ9Z205 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
RfxankQ9Z205 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
RfxankQ9Z205 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
RfxankQ9Z205 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
RfxankQ9Z205 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
RfxankQ9Z205 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
RfxankQ9Z205 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,39■■□□□ 1,49
RfxankQ9Z205 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
RfxankQ9Z205 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
RfxankQ9Z205 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
RfxankQ9Z205 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RfxankQ9Z205 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
RfxankQ9Z205 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
RfxankQ9Z205 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
RfxankQ9Z205 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
RfxankQ9Z205 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,2■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
RfxankQ9Z205 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfxankQ9Z205 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
RfxankQ9Z205 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
RfxankQ9Z205 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
RfxankQ9Z205 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
RfxankQ9Z205 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
RfxankQ9Z205 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
RfxankQ9Z205 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
RfxankQ9Z205 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,99■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
RfxankQ9Z205 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
RfxankQ9Z205 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
RfxankQ9Z205 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
RfxankQ9Z205 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
RfxankQ9Z205 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,86■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
RfxankQ9Z205 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,81■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
RfxankQ9Z205 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
RfxankQ9Z205 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
RfxankQ9Z205 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
RfxankQ9Z205 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
RfxankQ9Z205 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
RfxankQ9Z205 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
RfxankQ9Z205 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
RfxankQ9Z205 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
RfxankQ9Z205 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
RfxankQ9Z205 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
RfxankQ9Z205 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,8 ms