Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VarsQ9Z1Q9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VarsQ9Z1Q9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VarsQ9Z1Q9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VarsQ9Z1Q9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VarsQ9Z1Q9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VarsQ9Z1Q9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VarsQ9Z1Q9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VarsQ9Z1Q9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VarsQ9Z1Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VarsQ9Z1Q9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VarsQ9Z1Q9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VarsQ9Z1Q9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VarsQ9Z1Q9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VarsQ9Z1Q9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VarsQ9Z1Q9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VarsQ9Z1Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VarsQ9Z1Q9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VarsQ9Z1Q9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VarsQ9Z1Q9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VarsQ9Z1Q9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VarsQ9Z1Q9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VarsQ9Z1Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VarsQ9Z1Q9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VarsQ9Z1Q9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VarsQ9Z1Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VarsQ9Z1Q9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VarsQ9Z1Q9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VarsQ9Z1Q9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VarsQ9Z1Q9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VarsQ9Z1Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VarsQ9Z1Q9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VarsQ9Z1Q9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VarsQ9Z1Q9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VarsQ9Z1Q9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VarsQ9Z1Q9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VarsQ9Z1Q9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VarsQ9Z1Q9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VarsQ9Z1Q9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VarsQ9Z1Q9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VarsQ9Z1Q9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VarsQ9Z1Q9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VarsQ9Z1Q9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VarsQ9Z1Q9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VarsQ9Z1Q9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VarsQ9Z1Q9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VarsQ9Z1Q9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VarsQ9Z1Q9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VarsQ9Z1Q9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VarsQ9Z1Q9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms