Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Pard6aQ9Z101 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Pard6aQ9Z101 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Pard6aQ9Z101 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Pard6aQ9Z101 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Pard6aQ9Z101 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Pard6aQ9Z101 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Pard6aQ9Z101 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Pard6aQ9Z101 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Pard6aQ9Z101 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Pard6aQ9Z101 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Pard6aQ9Z101 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Pard6aQ9Z101 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Pard6aQ9Z101 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Pard6aQ9Z101 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Pard6aQ9Z101 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Pard6aQ9Z101 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Pard6aQ9Z101 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Pard6aQ9Z101 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Pard6aQ9Z101 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,3■■□□□ 1
Pard6aQ9Z101 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Pard6aQ9Z101 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Pard6aQ9Z101 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Pard6aQ9Z101 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Pard6aQ9Z101 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Pard6aQ9Z101 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Pard6aQ9Z101 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Pard6aQ9Z101 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Pard6aQ9Z101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Pard6aQ9Z101 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Pard6aQ9Z101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Pard6aQ9Z101 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Pard6aQ9Z101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Pard6aQ9Z101 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Pard6aQ9Z101 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Pard6aQ9Z101 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Pard6aQ9Z101 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Pard6aQ9Z101 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Pard6aQ9Z101 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pard6aQ9Z101 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pard6aQ9Z101 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Pard6aQ9Z101 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,77■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Pard6aQ9Z101 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,7 ms