Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms